Её созданию предшествовала кропотливая аналитическая работа по изучению обстановки в сфере природопользования на территории Волковысского, Берестовицкого и Свислочского районов. Вся эта зона, а также Гродненский район ранее находились в ведении Гродненской межрайонной инспекции. Однако осуществлять эффективный контроль на всём периметре было непросто. При создании Волковысской инспекции Гродненская межрайонная была упразднена, а территория вокруг Гродно перешла под контроль непосредственно областной структуры. Костяк нового подразделения создали из опытных кадров.
Новую инспекцию возглавил Сергей Станиславович Алифировец, 19 октября 1981 года рождения, образование высшее. В 2015 году закончил факультет биотехнологии и аквакультуры БГСХА по специальности инженер-технолог промышленного рыбоводства. До назначения на должность работал заместителем начальника Жлобинской межрайонной инспекции Гомельской области.